O curso de Farmácia na Metodista forma profissionais capacitados para atuar nas principais áreas farmacêuticas. Além de proporcionar conhecimento em diferentes áreas, como produção de medicamentos, cosméticos e atenção farmacêutica, conta com infraestrutura de ponta composta por uma Farmácia-Escola e um Laboratório de Desenvolvimento e Controle Analítico e Farmacêutico.

Os estágios dos alunos de Farmácia também são realizados nas dependências da Metodista, em espaços como a Policlínica, o Núcleo de Análises Clínicas e a Farmácia-Escola.