O curso de Fisioterapia da Anhembi Morumbi é disponibilizado nas modalidades presencial e semipresencial aos estudantes. O curso possui duração média de quatro anos (oito semestres) e carga horária total de 4.072 horas, de acordo com o sistema eMEC, do Ministério da Educação.

Através do seu portal, a instituição de ensino afirma que a formação neste curso concede conhecimentos para trabalhar em hospitais, clínicas de fisioterapia e em empresas privadas atuando na área de Fisioterapia do trabalho.

O curso de Fisioterapia foi avaliado com nota máxima (5) no indicador de Conceito de Curso (CC), do Ministério da Educação. A nota máxima foi concedida em três campi da instituição de ensino: Campus Mooca (São Paulo), São José dos Campos e Piracicaba.