A sede da FAPE está localizada no centro de Presidente Epitácio, a cerca de 650 km da capital paulista.
Em sua estrutura física, a instituição possui salas de aula, anfiteatro, biblioteca, brinquedoteca, videoteca, laboratórios de informática, salão nobre, restaurante universitário, áreas de convivência e centro esportivo, que inclui piscinas, quadra poliesportiva, quadra de tênis e campo de futebol. Também conta com Escritório de Práticas Contábeis, Escritório Modelo, Sala de Júri e Simulado e Núcleo de Prática Jurídica.