Atualmente, o IF Farroupilha possui 12 unidades: uma administrativa (em Santa Maria) e outras onze sendo formadas por dez campi e um campus avançado. Ele está presente nas cidades de Alegrete, Frederico Westphalen, Jaguari, Júlio de Castilhos, Panambi, Santa Rosa, Santo Ângelo, Santo Augusto, São Borja, São Vicente do Sul e Uruguaiana. Conta ainda com polos de apoio ao ensino a distância espalhados pelo Rio Grande do Sul.
Suas instalações incluem salas de aula, bibliotecas, laboratórios, refeitórios, moradias estudantis, ginásios, setores administrativos e áreas de convivência.