A Uninilton Lins possui unidades no estado do Amazonas, localizadas em Manaus (Parque das Laranjeiras, Japiim e Cidade Leste) e em Manacapuru.
Em sua sede, na cidade de Manaus, há uma área de um milhão de m² que reúne grupos e laboratórios especializados de pesquisa, incluindo um fragmento de floresta urbana e uma fazenda experimental.
A Uninilton Lins está sediada na Av. Professor Nilton Lins, 3259. Parque das Laranjeiras – Manaus/AM. CEP: 69058-030.