Além da cidade do Rio de Janeiro, a Uerj está presente em outros seis municípios fluminenses: Duque de Caxias, Nova Friburgo, Petrópolis, Resende, São Gonçalo e Teresópolis.
Sua infraestrutura conta com salas de aula, mais de 500 laboratórios acadêmicos, anfiteatros, editora, auditórios e bibliotecas. Além disso, possui o Hospital Universitário Pedro Ernesto (Hupe), que atende pacientes encaminhados por outras unidades públicas de saúde, e a Policlínica Piquet Carneiro, maior posto de assistência médica da América Latina, que atende, em média, 30 mil pacientes por mês.