A sede da Unifesspa fica em Marabá, a cerca de 550 km de Belém, no Pará. A instituição possui cinco campi, distribuídos em oito unidades de ensino, sendo: três em Marabá; duas em Xinguara; uma em Rondon do Pará; uma em Santana do Araguaia e uma em São Félix do Xingu.
Sua estrutura conta com salas de aula, laboratórios de informática, laboratórios específicos, empresas juniores, auditórios e bibliotecas.