A sede da UNIMAR está localizada na Avenida Hygino Muzzy Filho, 1001, Marília-SP, Cep 17.525–902.
Com 143 mil m², a instituição possui salas de aula climatizadas, biblioteca física e digital, anfiteatro com capacidade para 500 pessoas, áreas de convivência e centro poliesportivo. Também conta com 12 blocos para as atividades acadêmicas, Tribunal do Júri, Hospital Beneficente Unimar, Hospital Veterinário, Fazenda Experimental, laboratórios e ambulatórios de especialidades clínicas, laboratório de rádio e TV e específicos para outros cursos.