Bosch nasceu em Hertogenbosch, Holanda, por volta de 1450. Seu verdadeiro nome era Jeroen van Aken.
Bosch era de uma família de pintores. Dividiu com o pai e os irmãos um ateliê em sua cidade natal. Logo se casou com uma mulher rica chamada Aleid van de Meervenne, o que permitiu que Bosch se dedicasse completamente à pintura.
Ele experienciou a explosão do Renascimento, um período de efervescência cultural, artística e científica que teve início na Itália e se espalhou pela Europa.
Bosch, apesar de sua formação profundamente religiosa, mostrou influência dos pensamentos do Renascimento. Podemos perceber isso através de seus trabalhos com críticas à Igreja e influência de ideias humanistas.
Acredita-se, inclusive, que Bosch era um estudioso da alquimia, devido a muitos temas presentes em seus trabalhos.
Não há registro que Bosch tenha deixado sua cidade natal em algum momento de sua vida.
Ele morreu em 1516.