A sede da FACON está localizada em Conchas, município a cerca de 180 km da capital paulista. Entre os destaques da estrutura oferecida pela instituição estão auditório, biblioteca, estúdio multimídia e laboratório de informática.
A FACON também possui mais de 100 polos de apoio ao aluno de ensino a distância distribuídos em várias cidades brasileiras.