A sede do UNINTA está localizada em Sobral, a cerca de 240 km da capital do Ceará. A instituição também conta com polos de apoio ao ensino a distância, distribuídos em vários estados brasileiros.
Em sua estrutura, possui laboratórios e salas de aula climatizadas, com recursos audiovisuais, biblioteca, auditório, além de Hospital de Grandes Animais, Hospital Veterinário, farmácia- escola e clínica-escola de Psicopedagogia e de Fisioterapia.