A Universidade Presbiteriana Mackenzie possui três campi distribuídos em São Paulo. Um dos principais campus é o campus Higienópolis, localizado em um dos bairros nobres da cidade. A unidade conta com uma infraestrutura completa, incluindo biblioteca, laboratórios, salas de aula modernas, auditórios, área de convivência e restaurantes.
Outro importante campus da Mackenzie é a unidade de Alphaville, que fica localizada na região metropolitana de São Paulo. O campi é integrado por salas de aula equipadas com tecnologia, laboratórios especializados, além de uma ampla área de convivência.
Por fim, a Mackenzie ainda dispõe de um campus em Campinas, que fica localizado na região central da cidade. A unidade apresenta laboratórios modernos e salas de aula equipadas com recursos tecnológicos.
A instituição possui, ainda, colégios e polos espalhados por todo país.