A sede administrativa da UFMS está localizada na Cidade Universitária, em Campo Grande (MS), reunindo seus principais institutos e faculdades. A instituição atua em modelo multicampi e apresenta infraestrutura acadêmica, científica e tecnológica de grande porte.
- Faculdades e institutos da sede: Facfan, Inbio, Inisa, Fach, Faed, Faalc, Facom, Fadir, Famed, Famez, Faodo, Faeng, Inma, Inqui, Infi.
- 9 câmpus regionais: Aquidauana, Chapadão do Sul, Corumbá, Coxim, Naviraí, Nova Andradina, Paranaíba, Ponta Porã e Três Lagoas.
- Presença em 22 cidades por meio de polos EaD (UAB, polos próprios e polos nos câmpus).
- Infraestrutura EaD: Agead (Agência de Educação Digital e a Distância), com suporte pedagógico e tecnológico.
- Equipamento estratégico: Hospital Universitário Maria Aparecida Pedrossian.