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Ricardo, muito simples. Basta ir até a faculdade ou um polo, se for o caso e solicitar a segunda via do certificado. Somente esteja atento para o fato de que você terá que pagar uma taxa, mas fique tranquilo, o certificado será emitido sem problemas, desde que você consiga provar que completou o curso e não tem nenhum tipo de pendências como mensalidades atrasadas.