A sede da Unidesc fica em Luziânia, a cerca de 200 km de Goiânia (GO), no bairro Jardim Flamboyant. Sua outra unidade, conhecida como campus II, fica na cidade de Valparaíso de Goiás, em Goiás.
Em sua infraestrutura, além das salas de aula, dispõe de laboratórios específicos, biblioteca, clínica-escola, empresa júnior, Núcleo de Orientação Psicopedagógica e Núcleo de Prática Jurídica.