Na rua da Consolação, região central de São Paulo, a sede da FASIG tem localização privilegiada, próxima ao metrô Higienópolis (Linha Amarela).
Entre os destaques da estrutura oferecida pela instituição estão biblioteca, salas de estudo, laboratório de informática e laboratórios específicos para os cursos (de anatomia, microscopia e práticas hospitalares).