A FMUpossui sete campi, dentre eles estão: Liberdade, Anhembi e Santo Amaro.
O campus Liberdade fica no centro da cidade e conta com uma infraestrutura moderna, com salas de aulas equipadas, laboratórios de informática e biblioteca com grande acervo. Além disso, o campus possui um teatro, auditório, quadra poliesportiva e uma piscina semiolímpica.
Já o campus Anhembi está localizado na região norte da cidade e possui uma área verde extensa, com bosques e jardins. A infraestrutura do campus conta com salas de aula modernas, laboratórios de informática, biblioteca, auditório e um complexo esportivo com piscina semiolímpica, quadras e campo de futebol.
O campus Santo Amaro fica na região sul da cidade e possui uma infraestrutura moderna, com salas de aulas equipadas, biblioteca, laboratórios de informática, além de contar com um centro esportivo com piscina semiolímpica, quadras e campo de futebol.