A sede da UniSãoJosé fica no bairro Realengo, na cidade do Rio de Janeiro.
Em suas instalações, conta com salas de aula, auditório com capacidade para 100 pessoas, laboratórios específicos, sala de raios-x, sala de Anatomia e Morfologia, clínicas de Odontologia, Fisioterapia e Assistência Jurídica, quadras poliesportivas, piscina semi-olímpica de 450 m², com vestiário e banheiros, ginásio polivalente coberto.