A UFABC possui dois campi: um em Santo André, sua sede, e outro em São Bernardo do Campo, ambos municípios localizados no ABC paulista.
Entre os destaques da estrutura oferecida pela instituição estão bibliotecas, auditórios, restaurantes universitários, Centro de Ciências Naturais e Humanas, Centro de Matemática, Computação e Cognição e Centro de Engenharia, Modelagem e Ciências Sociais Aplicadas. A universidade também conta com laboratórios específicos para diversas áreas e transporte interunidades.