A sede da UFRRJ fica em Seropédica, a cerca de 75 km de distância do Rio de Janeiro (RJ). Possui ainda outros três campi, nas cidades fluminenses de Nova Iguaçu, Três Rios e Campos dos Goytacazes.
Em suas instalações, dispõe de bibliotecas (com amplo acervo bibliográfico), prédios de alojamento, anfiteatro, laboratórios específicos, auditórios, restaurante universitário, hospital veterinário, editora, jardim botânico, fazenda universitária, cantinas e áreas de convivência.