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Joice, além da CAPES, alguns Programas de Pós-graduação da UFSCAR também possuem cotas institucionais do CNPq, sendo estas gerenciadas e implementadas diretamente pelos mesmos, sem a participação da Pró-Reitoria de Pós-graduação. Para maiores informações, sugiro que você entre em contato diretamente com a Instituição, principalmente para casos de natureza especial que não foram mencionados na pergunta.