A UFVJM possui cinco unidades em Minas Gerais: o campus I e o campus JK, em Diamantina; o campus Mucuri, em Teófilo Otoni; o campus Janaúba e o campus Unaí, nas cidades de mesmo nome.
Em sua infraestrutura, é possível encontrar além das salas de aula, laboratórios específicos, auditórios, anfiteatro, museu, sala de estudos, bibliotecas, laboratórios de informática, áreas de convivência, clínica-escola, fazenda experimental, clínica odontológica, farmácia-escola, ginásio poliesportivo, cervejaria-escola, padaria-escola, laboratórios de simulação de situações práticas e lousas digitais.