A Unicid possui unidades na capital paulista. A sede é localizada no bairro do Tatuapé, e a unidade Pinheiros recebe os alunos do curso de Medicina desde 2016.
A instituição também oferece cursos de ensino a distância. Para isso, possui polos de apoio distribuídos por todo o território nacional. Há bibliotecas em São Paulo e outras 150 nos polos dos cursos a distância.