O UNIFAA possui três campi em Valença, a cerca de 150 km de distância do Rio de Janeiro (RJ): sede, saúde e Hospital Veterinário Escola. Além disso, tem polos de apoio ao ensino a distância espalhados pelo estado, nas cidades de Barra do Piraí, Barra Mansa, Petrópolis, Paty do Alferes, Resende, Teresópolis e Três Rios.
Sua infraestrutura inclui, além das salas de aulas, laboratórios específicos, júri simulado, núcleo de práticas jurídicas, auditório e estacionamento.