As atividades administrativas e acadêmicas da Unilab estão concentradas no Ceará e na Bahia. No Ceará, as unidades ficam nas cidades de Redenção e Acarape. Na Bahia, ela está presente em São Francisco do Conde.
Em suas instalações, há salas de aula, laboratórios específicos, auditórios, bibliotecas, núcleo de inovação tecnológica, fazenda experimental e restaurantes universitários.