A Unilab tem sedes no Ceará e na Bahia. No Ceará, mantém unidades nas cidades de Redenção e Acarape. Na Bahia, está presente no município de São Francisco do Conde.
Sua infraestrutura conta com salas de aula, laboratórios, bibliotecas, auditórios, núcleo de inovação tecnológica, fazenda experimental e restaurantes universitários.
A universidade é composta por dez institutos acadêmicos, incluindo o Instituto de Ciências da Saúde (ICS), Instituto de Engenharias e Desenvolvimento Sustentável (IEDS) e Instituto de Educação a Distância (IEAD).