O curso de bacharelado em Fisioterapia da Unip é ofertado nas modalidades presencial e semipresencial (Flex) com duração de quatro anos (oito semestres). Na modalidade presencial, pelo menos 60% da carga horária das aulas é realizada presencialmente no campus, enquanto o formato Flex mescla as modalidades educação a distância (EaD) e presencial.

Um dos diferenciais para o corpo discente de Fisioterapia é a realização da parte prática em diversos laboratórios da instituição de ensino. O estudante de Fisioterapia da Unip poderá ter acesso aos laboratórios de Anatomia, Microscopia e Microbiologia, Cinesiologia e Cinesioterapia, Massoterapia, Eletroterapia, Hidroterapia, além de Fisiologia e Bioquímica.

O aluno terá a possibilidade de estagiar em hospitais (Enfermaria e UTI) ou em locais destinados à área da Saúde Coletiva e Preventiva (UBS, Policlínica, asilos, Creches e Indústrias).

Na modalidade presencial, a Unip disponibiliza o curso em diversos campi localizados na cidade de São Paulo e no interior do Estado de São Paulo, além das capitais Brasília, Manaus e Goiânia. Vale destacar também que o MEC avalia o curso, disponibilizado na modalidade semipresencial/EaD, com a nota 4 (escala máxima até 5) no indicador de Conceito de Curso (CC).