A UniSul conta com nove unidades distribuídas pelo estado de Santa Catarina, localizadas em Araranguá, Braço do Norte, Criciúma, Florianópolis (Centro e Continente), Itajaí, Palhoça e Tubarão.
Além dessas unidades presenciais, a instituição também possui polos voltados à educação a distância, ampliando o acesso ao ensino superior.
A estrutura da universidade inclui um Centro Integrado de Saúde, com atendimentos especializados que fomentam a prática acadêmica, além de laboratórios de informática, auditórios e núcleos práticos que garantem suporte completo às atividades pedagógicas.