A Unisul possui onze unidades: Araranguá, Balneário Camboriú, Braço do Norte, Criciúma, Florianópolis Centro, Florianópolis Continente, Florianópolis Ilha, Içara, Itajaí,Palhoça e Tubarão.
A universidade conta com uma estrutura de laboratórios de informática, laboratórios específicos para aulas práticas e pesquisa, biblioteca e serviços de conveniência disponíveis para os alunos.
Além disso, tem também incubadora, escritório modelo de Direito, auditório, museus, serviços gratuitos de atendimento ao estudante, centro de práticas naturais, salas multimídia, complexo esportivo com piscinas e diferentes quadras.
A sede da IES está localizada no município de Tubarão-SC. A Unisul, de acordo com o sistema eMEC, é sediada na Av. José Acácio Moreira, 787, Bairro Dehon. nº 787.