A sede e dois campi da UPF estão localizados em Passo Fundo, cidade ao Noroeste do Rio Grande do Sul. Além disso, a instituição possui outros seis campi: em Carazinho, Casca, Lagoa Vermelha, Palmeira das Missões, Soledade e Sarandi.
Em sua infraestrutura, conta com salas de aula, bibliotecas, laboratórios específicos, museus, clínicas, hospital veterinário, anfiteatros e auditórios. Dispõe também de salas de ensino prático experimental, ginásios poliesportivos, emissora de TV universitária, emissoras de rádio, editora, centro de línguas, centro de convivência e uma ampla área verde.