A sede da FGV na cidade do Rio de Janeiro está localizada no bairro de Botafogo, próximo da estação Flamengo do metrô. A instituição se divide em várias escolas, de acordo com as áreas dos cursos, como a Escola Brasileira de Administração Pública e de Empresas (EBAPE), a Escola de Matemática Aplicada (EMAP) e a Direito Rio.
Entre as instalações disponíveis, os alunos encontram salas de aula climatizadas e com equipamento multimídia, bibliotecas, cinco auditórios, laboratórios de informática e núcleo de prática jurídica.