A PUC-SP foi responsável pela criação do primeiro curso de pós-graduação organizado do Brasil, em 1969, e pelo Ciclo Básico de Ciências Humanas, em 1971.
Desde a sua fundação, a universidade ampliou sua atuação acadêmica e implementou iniciativas voltadas à inclusão social. Em 2006, passou por um processo de modernização institucional, que incluiu a reintegração da Faculdade de Teologia e a revisão de seus estatutos.
Ao longo de sua história, manteve-se como uma das universidades privadas mais reconhecidas do país, com projeção nacional e internacional. A instituição também se destaca por promover a participação estudantil em projetos de pesquisa e extensão.
Entre os principais diferenciais da PUC-SP estão a diversidade de cursos oferecidos, o corpo docente qualificado formado majoritariamente por doutores e pesquisadores, e a infraestrutura voltada para o ensino, pesquisa e extensão.
A universidade mantém programas de intercâmbio com instituições do exterior, incentivando a internacionalização. Os alunos contam com bibliotecas, estúdios de TV e rádio, laboratórios e salas equipadas com tecnologia, como internet de alta velocidade e sistemas de projeção.
A integração com a comunidade por meio de atividades práticas e projetos sociais também compõe a proposta de formação da instituição.