• A Unifesp possui campi em São Paulo, Diadema, Guarulhos, São José dos Campos, Osasco, Baixada Santista e Zona Leste de São Paulo.
• O Campus São Paulo, núcleo histórico da instituição, abriga a Escola Paulista de Medicina e a Escola Paulista de Enfermagem, além de laboratórios, bibliotecas e espaços de convivência.
• O Campus Diadema concentra pesquisas em ciências ambientais, químicas e farmacêuticas; Guarulhos oferece cursos nas ciências humanas; Osasco abriga áreas como Administração, Direito e Relações Internacionais, incluindo a Escola Paulista de Política, Economia e Negócios (EPPEN); e São José dos Campos é sede do Instituto de Ciência e Tecnologia.
• As unidades são equipadas com laboratórios, auditórios, restaurantes universitários e instalações modernas para alunos e docentes.