Devido à alta capacidade de mutação dos vírus, eles se apresentam de diversas formas na natureza, com diferentes estruturas.
Quando o vírus está fora da célula hospedeira, assume a forma de vírion, ou seja, uma unidade viral completa. O vírion é composto por material genético, podendo possuir RNA ou o DNA, sendo que uma pequena parcela apresenta ambos e proteínas. Além disso, o vírion pode possuir uma proteína denominada transcriptase reversa, proteína que é capaz de transformar DNA a partir de RNA viral, ganhando o nome de Retrovírus.
Outra estrutura que podemos encontrar nos vírus é o capsídeo proteico, responsável por proteger o ácido nucleico, que junto ao material genético, são denominados nucleocapsídeo.
Dentre os diversos tipos de vírus, estão os bacteriófagos, também conhecidos como fagos, organismos que infectam somente procariotos. Vários desses seres possuem o corpo dividido em três partes: a cabeça, onde está concentrado o maior volume do vírus e também onde está localizado o material genético; a cauda, que possui formato cilíndrico e alongado, fazendo conexão com as fibras da cauda; e as próprias fibras da cauda, importantes estruturas que auxiliam na conexão entre o vírus e a bactéria que será parasitada.
Por fim, existem alguns tipos de vírus que apresentam em sua estrutura o envelope lipídico. Essa estrutura é obtida na célula e possui glicoproteínas que facilitam a interação com uma futura célula hospedeira. A presença do envelope caracteriza o vírus em mais duas categorias: os envelopados, como o vírus da herpes e o HIV, e os não envelopados, como o vírus da poliomielite e HPV.